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Série chronologique du programme de saumon juvénile de l'Institut Hakai
Hakai Institute / Hakai Institut
Johnson, Brett; Gan, Julian; Godwin, Sean; Bachen, Krystal; van der Stap, Tim; Krkosek, Martin; Rogers, Luke A.; Portner, Lauren; Janusson, Carly; Hunt, Brian P. V.; Hakai Institute — 2017-05-11 The Hakai Institute Juvenile Salmon program is an ongoing initiative that was established in 2015 in partnership with the University of British Columbia, University of Toronto, Simon Fraser University and Salmon Coast Field Station. This program researches the early life history of juvenile salmon in coastal British Columbia. Primary research objectives are determining: 1) Migration timing rates and routes; 2) Migration habitat, including physical and chemical oceanographic conditions, and availability of plankton prey; 3) The impacts of prey phenology, quantity and quality on juvenile salmon growth and condition; 4) Species and stock-specific feeding biology and competitive interactions; 5) Pathogen and parasite infection dynamics; and 6) Mortality estimates. The program targets Fraser River sockeye, and pink and chum salmon, but additionally provides information on coho, chinook, and herring through incidental capture. The field program operates between May and July during the peak of the juvenile sockeye outward migration. Purse seine and oceanographic sampling are conducted in the northern Strait of Georgia / Discovery Islands region (~ 220 km from the Fraser River mouth) and the Johnstone Strait / Queen Charlotte Strait region (~ 180 km from the northern Strait of Georgia. As such, this program informs early life history across two critical legs of the Fraser salmon northward migration. Data packages are updated annually. Versioned datasets are available through the links below. This data package is freely available to everyone, following the principles of equitable access and benefit sharing. However, we expect all data users to give attribution to the data providers (read our data license) and the use of these data should happen in the light of fair use, i.e.: 1) respect the data providers, and provide helpful feedback on data quality, and 2) communicate and/or collaborate with the providers if you are considering using this dataset for manuscripts or other forms of reporting. Le programme sur le saumon juvénile du Hakai Institute est une initiative permanente qui a été créée en 2015 en partenariat avec l'Université de la Colombie-Britannique, l'Université de Toronto, l'Université Simon Fraser et la station de terrain de Salmon Coast. Ce programme étudie le début du cycle biologique des saumons juvéniles sur la côte de la Colombie-Britannique. Les principaux objectifs de recherche sont de déterminer : 1) Délais et itinéraires de migration ; 2) L'habitat de migration, y compris les conditions océanographiques physiques et chimiques et la disponibilité de proies planctoniques ; 3) Les impacts de la phénologie, de la quantité et de la qualité des proies sur la croissance et la condition des saumons juvéniles ; 4) Biologie alimentaire et interactions compétitives spécifiques aux espèces et aux stocks ; 5) Dynamique des infections par les agents pathogènes et les parasites ; et 6) Estimations de la mortalité. Le programme cible le saumon rouge du fleuve Fraser, le saumon rose et le saumon kéta, mais fournit également des informations sur le coho, le quinnat et le hareng grâce à des captures fortuites. Le programme sur le terrain se déroule entre mai et juillet, au plus fort de la migration vers l'extérieur des saumons rouges juvéniles. Des échantillonnages océanographiques et à la senne coulissante sont effectués dans la région nord du détroit de Géorgie et des îles Discovery (à environ 220 km de l'embouchure du fleuve Fraser) et dans la région du détroit de Johnstone et du détroit de la Reine-Charlotte (à environ 180 km du nord du détroit de Géorgie). À ce titre, ce programme éclaire le début du cycle biologique de deux étapes critiques de la migration du saumon du Fraser vers le nord. Les packages de données sont mis à jour chaque année. Les ensembles de données versionnés sont disponibles via les liens ci-dessous. Cet ensemble de données est librement accessible à tous, conformément aux principes d'accès équitable et de partage des avantages. Cependant, nous attendons de tous les utilisateurs de données qu'ils attribuent leurs fournisseurs de données (lisez notre licence de données) et que l'utilisation de ces données doit se faire dans le cadre d'une utilisation équitable, c'est-à-dire : 1) respecter les fournisseurs de données et fournir des commentaires utiles sur la qualité des données, et 2) communiquer et/ou collaborer avec les fournisseurs si vous envisagez d'utiliser cet ensemble de données pour des manuscrits ou d'autres formes de rapports. https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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Composition de la matière organique particulaire pour les stations d'eau douce et marines de 2015 à 2018 sur la côte centrale, en Colombie-Britannique, au Canada.
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St. Pierre, Kyra; Hunt, Brian P. V.; Giesbrecht, Ian; Tank, Suzanne; Lertzman, Ken; Del Bel Belluz, Justin; Froese, Tyrel; Olson, Angeleen; Hessing-Lewis, Margot; Hakai Institute — 2022-01-07 This data package includes two datasets used to assess spatial and temporal patterns in particulate organic matter (POM) chemical composition in surface (0-10 m) waters at 11 oceanographic stations along British Columbia’s Central Coast, associated with St. Pierre et al. (2022, submitted). The datasets within the data package include: ‘Oceanographic station mixture dataset.csv’: Particulate organic carbon (POC) and particulate nitrogen (PN) concentrations and stable isotope signatures (δ13C, δ15N) and ratios of carbon-to-nitrogen (C:N) in surface waters (0-10 m) across 11 oceanographic stations, sampled during routine monthly surveys conducted between January 21st 2015 and September 11th 2018. Also includes water temperature, salinity, chlorophyll a concentrations, and POC-to-chlorophyll a ratios. ‘End-member raw data.csv’: Particulate organic carbon (POC) and particulate nitrogen (PN) concentrations and stable isotope signatures (δ13C, δ15N) and ratios of carbon-to-nitrogen (C:N) in marine phytoplankton, terrestrial, and marine intertidal macrophyte POM sources. Note that means ± standard deviations for each source were used in the Bayesian mixing model presented in St. Pierre et al. (in review). Marine intertidal macrophyte data are a subset from Froese et al. (2019). Sample collection and processing information can be found in: St. Pierre, K.A., Hunt, B.P.V., Giesbrecht, I., Tank, S.E., Lertzman, K.P., Del Bel Belluz, J., Hessing-Lewis, M.L., Olson, A., Froese, T. Marine particulate organic matter chemistry reflects seasonally and spatially variable contributions from terrestrial, intertidal and marine pelagic sources in the Northeast Pacific coastal temperate rainforest. (In review) Information on the collection of the marine intertidal macrophyte data can be found in: Froese, T., Sadlier-Brown, G., Olson, A.M., and Hessing-Lewis, M. (2019). Nearshore macrophyte stable isotope results from BC’s Central Coast, 2014-2018. Hakai Institute dataset. https://doi.org/10.21966/q31x-qg72 Cet ensemble de données comprend deux ensembles de données utilisés pour évaluer les patrons spatiaux et temporels de la composition chimique de la matière organique particulaire (POM) dans les eaux de surface (0-10 m) à 11 stations océanographiques le long de la côte centrale de la Colombie-Britannique, associées à Saint-Pierre et al. (2022, soumis). Les ensembles de données du package de données incluent : 'Mélange de stations océanographiques dataset.csv ': Concentrations de carbone organique particulaire (POC) et d'azote particulaire (PN) et signatures isotopiques stables (δ13C, Δ15N) et rapports carbone/azote (C:N) dans les eaux de surface (0-10 m) dans 11 stations océanographiques, échantillonnés au cours d'enquêtes mensuelles de routine menées entre le 21 janvier 2015 et le 11 septembre 2018. Comprend également la température de l'eau, la salinité, les concentrations de chlorophylle a et les rapports POC-chlorophylle a. « data.csv brut des membres finaux » : Concentrations de carbone organique particulaire (POC) et d'azote particulaire (PN) et signatures isotopiques stables (δ13C, Δ15N) et rapports carbone/azote (C:N) dans le phytoplancton marin, les sources de POM de macrophytes terrestres et intertidaux marins. Notez que les moyennes ± écarts types pour chaque source ont été utilisées dans le modèle de mélange bayésien présenté dans St. Pierre et al. (en cours de révision). Les données sur les macrophytes intertidaux marins sont un sous-ensemble de Froese et al. (2019). Les informations relatives à la collecte et au traitement des échantillons peuvent être trouvées dans : St. Pierre, K.A., Hunt, B.P.V., Giesbrecht, I., Tank, SE, Lertzman, K.P., Del Bel Belluz, J., Hessing-Lewis, M.L., Olson, A., Froese, T. La chimie des particules organiques marines reflète les contributions saisonnières et spatiales variables des sources pélagiques terrestres, intertidales et marines du Nord-Est Forêt pluviale tempérée côtière du Pacifique. (En cours de révision) Des informations sur la collecte des données sur les macrophytes intertidaux marins peuvent être trouvées dans : Froese, T., Sadlier-Brown, G., Olson, A.M. et Hessing-Lewis, M. (2019). Résultats des isotopes stables des macrophytes près du rivage de la côte centrale de la Colombie-Britannique, de 2014 à 2018. Ensemble de données de l'Institut Hakai. https://doi.org/10.21966/q31x-qg72 https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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Nutriments et carbone organique dissous dans les eaux douces et marines du chenal Kwakshua, Colombie-Britannique, Canada. La version 1.0.
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St. Pierre, Kyra; Hunt, Brian P. V.; Tank, Suzanne; Giesbrecht, Ian; Floyd, William; Korver, Maartje C.; Oliver, Allison A.; Lertzman, Ken; Hakai Institute — 2020-08-10 This data package contains data associated with the manuscript St. Pierre et al. (2020), to be submitted to Biogeosciences. Data in this package characterise spatial and temporal variability in nutrient (nitrogen, phosphorus, iron, silica) and dissolved organic carbon (DOC) concentrations in seven freshwater streams on Calvert and Hecate Islands, and the surface (0-5 m) waters at 13 marine stations within Meay and Kwakshua Channels on the British Columbia Central Coast. Briefly, the streams and marine stations were sampled at approximately monthly intervals between August 2014 and December 2018. Detailed information on sampling protocols, sample analysis, and data processing can be found in St. Pierre et al. (2020). There are 4 datasets associated with this package. Data dictionaries associated with each dataset are included in the ‘Data dictionary.xlsx’ spreadsheet. Methodological information is detailed in St. Pierre et al. (2020). Each dataset is described below: ‘Freshwater Chemistry (2014-2018) - Final.csv’: Concentrations of nutrients and dissolved organic carbon in mg/L. Used with discharge data to calculate stream fluxes. ‘All watershed nutrient fluxes - Final.csv’: Daily nutrient and organic carbon fluxes by watershed between 1-Aug-2014 and 31-Dec-2018. Also includes stoichiometric ratios of the fluxes. ‘Marine Nutrient + YSI data - Final.csv’: Measured surface water (0-5 m) nutrient and dissolved organic carbon chemistry across 13 marine stations in Kwakshua and Meay Channels. ‘Watershed Time Series - Rain and Air Temp.csv’: Watershed-specific monthly mean, minimum, and maximum air temperature and total monthly rainfall. Climate normals, model monthly temperature and precipitation were extracted from climatewna.com (Wang et al. 2016) using the weather station coordinates for comparison with the measured quantities and are also included. Detailed methodology is found in: St. Pierre, K.A., Hunt, B.P.V, Tank, S.E., Giesbrecht, I., Floyd, W.C., Korver, M.C., Lertzman, K. (2020) Rain-fed streams dilute inorganic nutrients but subsidise organic matter-associated nutrients in coastal waters of the northeast Pacific Ocean. [To be submitted to Biogeosciences] Associated are the discharge dataset (Korver et al. 2019a) and stream rainfall event sampling dataset (Korver et al. 2019b). Stream rainfall event chemistry is integrated into the ‘Freshwater Chemistry (2014-2018) Final.csv’ dataset. Ce paquet de données contient des données associées au manuscrit St. Pierre et al. (2020), à soumettre à Biogéosciences. Les données de cet ensemble caractérisent la variabilité spatiale et temporelle des concentrations de nutriments (azote, phosphore, fer, silice) et de carbone organique dissous (COD) dans sept cours d'eau douce des îles Calvert et Hécate, et dans les eaux de surface (0-5 m) de 13 stations marines dans les chenaux Meay et Kwakshua sur la côte centrale de la Colombie-Britannique. En bref, les cours d'eau et les stations maritimes ont été échantillonnés à des intervalles approximativement mensuels entre août 2014 et décembre 2018. Des informations détaillées sur les protocoles d'échantillonnage, l'analyse des échantillons et le traitement des données sont disponibles dans St. Pierre et al. (2020). Quatre jeux de données sont associés à ce package. Les dictionnaires de données associés à chaque jeu de données sont inclus dans la feuille de calcul « Data dictionary.xlsx ». Les informations méthodologiques sont détaillées dans St. Pierre et al. (2020). Chaque jeu de données est décrit ci-dessous : « Chimie des eaux douces (2014-2018) - Final.csv » : Concentrations de nutriments et de carbone organique dissous en mg/L. Utilisées avec les données sur les rejets pour calculer les flux des cours d'eau. « Flux nutritifs de tous les bassins versants - Final.csv » : flux quotidiens de nutriments et de carbone organique par bassin versant entre le 1er août 2014 et le 31 décembre 2018. Inclut également les rapports stoechiométriques des flux. « Données sur les éléments nutritifs marins + YSI - Final.csv » : Mesure de la chimie des nutriments et du carbone organique dissous dans les eaux de surface (0-5 m) dans 13 stations marines des chenaux Kwakshua et Meay. « Série chronologique des bassins versants - Pluie et air Temp.csv » : températures mensuelles moyennes, minimales et maximales de l'air et précipitations mensuelles totales propres au bassin versant. Les normales climatiques, la température mensuelle du modèle et les précipitations ont été extraites du site climatewna.com (Wang et al. 2016) en utilisant les coordonnées de la station météorologique pour comparaison avec les quantités mesurées et sont également incluses. La méthodologie détaillée se trouve dans : Saint-Pierre, K.A., Hunt, B.P.V, Tank, SE, Giesbrecht, I., Floyd, W.C., Korver, M.C., Lertzman, K. (2020) Les cours d'eau pluviaux diluent les nutriments inorganiques mais subventionnent les nutriments associés à la matière organique dans les eaux côtières du nord-est de l'océan Pacifique. [À soumettre à Biogéosciences] L'ensemble de données sur les débits (Korver et al. 2019a) et l'ensemble de données d'échantillonnage des précipitations dans les cours d'eau (Korver et al. 2019b) sont associés. La chimie des précipitations dans les cours d'eau est intégrée dans le jeu de données « Chimie des eaux douces (2014-2018) Final.csv ». https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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Chimie du carbone organique dissous et particulaire pour les stations d'eau douce et marines de 2014 à 2016 sur les îles Calvert et Hécate, Colombie-Britannique, Canada. La version 1.0.
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Oliver, Alison A.; St. Pierre, Kyra A.; Tank, Suzanne E.; Hunt, Brian P. V.; Giesbrecht, Ian; Kellogg, Colleen T. E.; Jackson, Jennifer M.; Lertzman, Ken P.; Floyd, William C.; Korver, Maartje C.; Hakai Institute — 2020-02-04 This data package includes three datasets used to assess spatial and temporal patterns in dissolved organic carbon (DOC) and particulate organic carbon (POC) across freshwater streams and nearshore marine stations on Calvert and Hecate Islands on British Columbia’s Central Coast, associated with St. Pierre and Oliver et al. (2020, submitted). The datasets include: ‘Compiled Freshwater - Marine Dataset - Final.xlsx’: DOC and POC concentrations and stable isotope signatures across freshwater (n = 7), marine outlet-adjacent (n = 7) and marine-mid-channel (n = 6) stations, sampled during routine twice monthly or monthly surveys conducted between January 9th 2014 and November 23rd 2016. Also includes temperature, salinity, pH data (freshwater only), and total chlorophyll a concentrations (marine only) during the surveys. ‘Rainfall Events - Final.xlsx’: DOC and POC concentrations and stable isotope signatures, temperature, pH, salinity, and microbial cell counts across the two freshwater plumes surveyed during rainfall events on August 7th 2015 and September 19th 2015. ‘PARAFAC Results with all Associated Variables.xlsx’: Results of parallel factor (PARAFAC) analyses conducted on dissolved organic matter samples collected in 2016 from both freshwater and marine stations on Calvert and Hecate Islands. Sample collection and processing information can be found at: St. Pierre, K.A., Oliver, A.A., Tank, S.E., Hunt, B.P.V., Giesbrecht, I., Kellogg, C.T.E., Jackson, J.M., Lertzman, K.P., Floyd, W.C., Korver, M.C. (2020) Terrestrial exports of dissolved and particulate organic carbon to nearshore ecosystems of the Pacific coastal temperate rainforest. Ce jeu de données comprend trois ensembles de données utilisés pour évaluer les tendances spatiales et temporelles du carbone organique dissous (COD) et du carbone organique particulaire (POC) dans les cours d'eau douce et les stations marines côtières des îles Calvert et Hécate sur la côte centrale de la Colombie-Britannique, associées à Saint-Pierre et Oliver et al. (2020, soumis). Les ensembles de données incluent : « Compiled Freshwater - Marine Dataset - Final.xlsx »: Concentrations de COD et de POC et signatures d'isotopes stables dans les stations d'eau douce (n = 7), de sortie marine adjacente (n = 7) et de milieu de canal marin (n = 6), échantillonnées lors de relevés de routine bimensuels ou mensuels menés entre le 9 janvier 2014 et le 23 novembre 2016. Comprend également la température, la salinité, les données de pH (eau douce uniquement) et les concentrations totales de chlorophylle a (marine uniquement) pendant les relevés. « Rainfall Events - Final.xlsx » : Concentrations de COD et de POC et signatures d'isotopes stables, température, pH, salinité et numération des cellules microbiennes dans les deux panaches d'eau douce étudiés lors des pluies du 7 août 2015 et du 19 septembre 2015. « PARAFAC Results with all Associated Variables.xlsx »: Résultats des analyses de facteurs parallèles (PARAFAC) menées sur des échantillons de matière organique dissoute prélevés en 2016 dans les stations d'eau douce et marines des îles Calvert et Hécate. Les informations sur la collecte et le traitement des échantillons sont disponibles dans le document suivant : St. Pierre, K.A., Oliver, AA, Tank, S.E., Hunt, B.P.V., Giesbrecht, I., Kellogg, C.T.E., Jackson, J.M., Lertzman, K.P., Floyd, W.C., Korver, M.C. (2020) Terrestrial exports of dissolved and particulate organic carbon to nearshore ecosystems of the Pacific coastal temperate rainforest. https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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(auteur : Hunt, Brian P. V.)

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