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Global Water Futures (FRDR) Translation missing: fr.blacklight.search.logo
Response of finescale dace (Phoxinus neogaeus) gut microbiome to in situ experimental selenium exposure
Federated Research Data Repository / dépôt fédéré de données de recherche
Ankley, Phillip; Graves, Stephanie; Xie, Yuwei; DeBofsky, Abigail; Weber, Alana; Brinkmann, Markus; Palace, Vince; Hecker, Markus; Janz, David; Giesy, John — 2024-03-27 Selenium is an environmental contaminant of global concern that can cause adverse effects in fish at elevated levels. Fish gut microbiome play essential roles in gastrointestinal function and host health and can be perturbed by environmental contaminants, including metals and metalloids. Here, an in-situ selenium (Se) exposure of female finescale dace (Phoxinus neogaeus) using mesocosms at the International Institute for Sustainable Development - Experimental Lakes Area (IISD-ELA) was conducted to determine the impacts of Se accumulation on the gut microbiome and morphometric endpoints. 16S rDNA metabarcoding was employed to describe the gut microbiome. This dataset includes the demultiplexed sequencing output, the feature table with rarefied counts, the taxonomic annotations of sequences, and the sample metadata. https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Global Water Futures (FRDR) Translation missing: fr.blacklight.search.logo
The impact of fluoxetine on the gut microbiome of Pimephales promelas
Federated Research Data Repository / dépôt fédéré de données de recherche
Weber, Alana; Xie, Yuwei; Challis, Jonathan; DeBofsky, Abigail; Ankley, Phillip; Hecker, Markus; Jones, Paul; Giesy, John — 2024-03-27 This data is supplementary information regarding the effects of fluoxetine on the gut microbiome of Fathead Minnows when aqueously exposed to the compound. After a 28-day exposure to three different concentrations of fluoxetine; 0.01, 10 and 100 µg/L, or control (0 µg/L), fish were euthanized, and gut contents was collected. Using DNA extraction methods, PCR amplification and sequencing, bioinformatics was then performed to interpret the metagenomic data. All tests and data were collected between September 2019 and January 2021 at the University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, Canada. This data was generated to better understand how pharmaceuticals found downstream of wastewater treatment plants may impact the gut microbiome of aquatic organisms. https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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(auteur : Weber, Alana)

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